Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DQB1P01920 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DQB1P01920 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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