Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SERPINA1P01009 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SERPINA1P01009 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms