Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EGFRP00533 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EGFRP00533 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EGFRP00533 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EGFRP00533 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EGFRP00533 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EGFRP00533 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EGFRP00533 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EGFRP00533 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EGFRP00533 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EGFRP00533 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
EGFRP00533 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
EGFRP00533 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EGFRP00533 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EGFRP00533 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EGFRP00533 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EGFRP00533 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EGFRP00533 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EGFRP00533 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EGFRP00533 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EGFRP00533 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms