Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC31AO94979 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC31AO94979 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms