Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBNO60934 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBNO60934 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBNO60934 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBNO60934 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBNO60934 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBNO60934 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBNO60934 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBNO60934 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBNO60934 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBNO60934 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBNO60934 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NBNO60934 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBNO60934 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBNO60934 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBNO60934 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBNO60934 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBNO60934 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBNO60934 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBNO60934 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBNO60934 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBNO60934 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBNO60934 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms