Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF2O60811 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF2O60811 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms