Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOX15O60248 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOX15O60248 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOX15O60248 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOX15O60248 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOX15O60248 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOX15O60248 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOX15O60248 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOX15O60248 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOX15O60248 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOX15O60248 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SOX15O60248 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOX15O60248 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOX15O60248 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOX15O60248 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOX15O60248 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms