Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRNO43815 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRNO43815 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRNO43815 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STRNO43815 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRNO43815 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRNO43815 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRNO43815 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRNO43815 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRNO43815 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRNO43815 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRNO43815 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRNO43815 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRNO43815 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRNO43815 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRNO43815 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRNO43815 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRNO43815 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRNO43815 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRNO43815 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRNO43815 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRNO43815 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRNO43815 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRNO43815 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STRNO43815 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRNO43815 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRNO43815 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRNO43815 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRNO43815 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRNO43815 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRNO43815 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRNO43815 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRNO43815 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRNO43815 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STRNO43815 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRNO43815 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRNO43815 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRNO43815 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRNO43815 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRNO43815 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
STRNO43815 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STRNO43815 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRNO43815 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRNO43815 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRNO43815 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STRNO43815 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRNO43815 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STRNO43815 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms