Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PLXNB1O43157 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PLXNB1O43157 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms