Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA3EO15041 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA3EO15041 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms