Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIT3O14879 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms