Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3CDO00329 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms