Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP23O00161 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNAP23O00161 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms