Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVV-2B6SEH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ERVV-2B6SEH9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms