Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VGLL3A8MV65 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms