Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CFAP73A6NFT4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms