Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
A0A0U1RRA0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
A0A0U1RRA0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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