Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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