Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms