Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CLEC4M-208ENST00000596363 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 UQCRHL-201ENST00000483273 2180 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 DUOXA1-208ENST00000558996 2684 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 FETUB-201ENST00000265029 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SLC44A3-204ENST00000467909 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 IMPDH1P10-201ENST00000440965 1542 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 PROKR2-201ENST00000217270 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AL109936.1-201ENST00000442089 460 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 HYI-AS1-201ENST00000444386 545 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC011005.1-201ENST00000467614 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SLC16A14P1-201ENST00000506846 1117 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AL627230.3-201ENST00000622239 192 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC090061.1-201ENST00000500695 1733 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 OTUD6B-AS1-202ENST00000524003 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC005070.3-201ENST00000607968 2646 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC008659.1-201ENST00000501834 1458 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 IGBP1-201ENST00000342206 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 IL19-204ENST00000620365 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 NDUFA5-201ENST00000355749 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 NOL12-201ENST00000359114 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC006960.2-201ENST00000435254 531 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 FCGR2C-202ENST00000466542 1070 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 RN7SL313P-201ENST00000497618 288 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 DENND5B-AS1-202ENST00000537346 1106 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PTPRJQ12913 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 LINC01632-202ENST00000617368 533 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 AL627230.4-201ENST00000617851 370 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 pRNA.4-201ENST00000620973 89 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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