Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CHRNA2-202ENST00000407991 4067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 C12orf77-203ENST00000623395 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ASTN2-203ENST00000341734 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DDX23-201ENST00000308025 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC005618.2-201ENST00000618012 2297 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF583-201ENST00000291598 2538 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL596202.1-201ENST00000435295 3088 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF200-204ENST00000414144 3306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GOLGA8Q-201ENST00000562783 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL133355.1-201ENST00000568017 2388 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MYOCOS-201ENST00000636697 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LRGUK-201ENST00000285928 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 C9orf131-202ENST00000354479 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TK2-205ENST00000527284 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CYP17A1-207ENST00000639393 1684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL353616.2-201ENST00000413269 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC104394.1-201ENST00000611658 1748 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PCDHGC3-202ENST00000611950 2849 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PNPLA4-201ENST00000381042 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LRRFIP2-203ENST00000396428 1791 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GEMIN4-201ENST00000319004 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AC087163.3-201ENST00000624345 700 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 HVCN1-201ENST00000242607 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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LSAMPQ13449 SOX13-210ENST00000618875 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CHRNA1-202ENST00000348749 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MAP3K9-202ENST00000553414 3544 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 MGLL-203ENST00000398104 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 HERC2P4-205ENST00000566902 3957 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 AP003038.1-201ENST00000527289 1754 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 OLFML2A-201ENST00000288815 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 CETN3-201ENST00000283122 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 BTN2A3P-203ENST00000465856 2483 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 SCARA3-201ENST00000301904 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF17-206ENST00000601808 2524 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ANKRD36-201ENST00000420699 6269 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 PRDM1-201ENST00000369089 4675 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LSAMPQ13449 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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