Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPRJQ12913 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPRJQ12913 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPRJQ12913 EPM2A-213ENST00000638778 813 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPRJQ12913 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PTPRJQ12913 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 GNRH2-201ENST00000245983 425 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 GNRH2-202ENST00000359100 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 LHX9-202ENST00000367388 758 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 C9orf116-203ENST00000371791 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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