Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAXBP1Q9Y5B6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms