Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
DCAF1Q9Y4B6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC41.93■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC41.92■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
DCAF1Q9Y4B6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
DCAF1Q9Y4B6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms