Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF330Q9Y3S2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF330Q9Y3S2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms