Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3KQ9Y2Y1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3KQ9Y2Y1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms