Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP3Q9Y2W7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP3Q9Y2W7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms