Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMC3Q9UQE7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms