Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTNND2Q9UQB3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNND2Q9UQB3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNND2Q9UQB3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms