Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP22Q9UPT9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP22Q9UPT9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms