Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PHF8Q9UPP1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PHF8Q9UPP1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms