Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FZD1Q9UP38 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms