Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNPO2Q9UMS6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNPO2Q9UMS6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms