Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNRF3Q9ULT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNRF3Q9ULT6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms