Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3Q9UKS6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3Q9UKS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms