Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms