Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GGA2Q9UJY4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GGA2Q9UJY4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA2Q9UJY4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms