Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM10Q9UDY6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM10Q9UDY6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms