Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK2Q9UBU2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms