Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGNQ9P2M7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGNQ9P2M7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms