Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALCOCO1Q9P1Z2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALCOCO1Q9P1Z2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms