Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ARHGEF12Q9NZN5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
ARHGEF12Q9NZN5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARHGEF12Q9NZN5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms