Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM28Q9NW13 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBM28Q9NW13 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms