Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL1Q9NSC2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL1Q9NSC2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms