Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELLSQ9NRZ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELLSQ9NRZ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms