Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGEF3Q9NR81 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF3Q9NR81 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms