Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf4Q9NR00 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms