Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 TDRD3-203ENST00000377882 660 ntTSL 52.45□□□□□ -2.021e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.424e-15■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 55.6□□□□□ -1.513e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 GMDS-207ENST00000530459 520 ntTSL 34.47□□□□□ -1.693e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.836e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 RIF1-202ENST00000414861 2534 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 TWSG1-203ENST00000583147 2311 ntTSL 217.63■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 514.95□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 METTL15-206ENST00000451385 1868 ntTSL 511.57□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 METTL15-212ENST00000634973 1353 ntTSL 510.36□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 TMED5-203ENST00000370290 3847 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 METTL15-203ENST00000406787 4304 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 METTL15-209ENST00000634627 1178 ntTSL 59.46□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 CTSC-201ENST00000227266 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 TMED5-204ENST00000479918 1296 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 CTSC-207ENST00000533865 542 ntTSL 48.95□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 CTSC-204ENST00000527018 733 ntTSL 58.5□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 METTL15-204ENST00000407364 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 METTL15-208ENST00000532947 1419 ntTSL 57.43□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 MED14-206ENST00000482034 520 ntTSL 45.81□□□□□ -1.481e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 BAZ2B-206ENST00000437839 640 ntTSL 412.87□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 BAZ2B-213ENST00000483316 6838 ntTSL 1 (best)7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 BAZ2B-215ENST00000541068 594 ntTSL 44.21□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.832e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 BAZ2B-218ENST00000552327 454 ntTSL 33.32□□□□□ -1.882e-6■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 ILF3-216ENST00000589600 839 ntTSL 519.87■□□□□ 0.776e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.396e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.16e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 SCAMP1-203ENST00000510030 477 ntTSL 414.17□□□□□ -0.146e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 ILF3-218ENST00000590009 953 ntTSL 511.31□□□□□ -0.66e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.696e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 ILF3-213ENST00000589283 599 ntTSL 310.69□□□□□ -0.76e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 SCAMP1-207ENST00000621999 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.736e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 29.66□□□□□ -0.866e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.96e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 BAGE2-203ENST00000496773 2598 ntBASIC9.43□□□□□ -0.96e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 LINC00885-201ENST00000457079 1828 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.916e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.066e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.396e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 ILF3-224ENST00000593199 413 ntTSL 35.63□□□□□ -1.516e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 SBF2-202ENST00000420722 1188 ntTSL 55.51□□□□□ -1.536e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 SCAMP1-205ENST00000614488 1276 ntTSL 1 (best)4.44□□□□□ -1.76e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.96e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 SBF2-214ENST00000533770 4829 ntTSL 1 (best)2.74□□□□□ -1.976e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 SCAMP1-204ENST00000511551 559 ntTSL 42.45□□□□□ -2.026e-7■■■■□ 25.9
EXOSC5Q9NQT4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 MARCH8-207ENST00000602712 992 ntTSL 214.95□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 MARCH8-205ENST00000453980 695 ntTSL 58□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-202ENST00000526656 862 ntTSL 318.72■□□□□ 0.596e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-217ENST00000567044 893 ntTSL 518.29■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-214ENST00000534233 711 ntTSL 217.21■□□□□ 0.356e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-216ENST00000566681 621 ntTSL 416.79■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-209ENST00000565458 1029 ntTSL 516.79■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.196e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 215.27■□□□□ 0.036e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-210ENST00000565760 658 ntTSL 314.43□□□□□ -0.16e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-215ENST00000566584 676 ntTSL 514.06□□□□□ -0.166e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-219ENST00000568671 608 ntTSL 213.94□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-214ENST00000566481 538 ntTSL 413.81□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.256e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.416e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-207ENST00000530473 2023 ntTSL 511.84□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-210ENST00000531968 550 ntTSL 411.26□□□□□ -0.616e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.616e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.626e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.646e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-205ENST00000562406 519 ntTSL 39.42□□□□□ -0.96e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 HYOU1-209ENST00000531694 2357 ntTSL 29.28□□□□□ -0.926e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.266e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-203ENST00000562324 597 ntTSL 27.04□□□□□ -1.286e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-208ENST00000565353 477 ntTSL 45.72□□□□□ -1.496e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 FAM192A-221ENST00000570184 593 ntTSL 33.12□□□□□ -1.916e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF124-203ENST00000476312 504 ntTSL 22.93□□□□□ -1.949e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 DENND1B-202ENST00000294737 3043 ntTSL 215.7■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 DENND1B-205ENST00000422998 583 ntTSL 314.76□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 DENND1B-201ENST00000235453 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.971e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 DENND1B-203ENST00000294738 508 ntTSL 53.92□□□□□ -1.781e-6■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-214ENST00000461469 560 ntTSL 318.31■□□□□ 0.529e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-211ENST00000444719 762 ntTSL 317.44■□□□□ 0.389e-7■■■■□ 25.8
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-205ENST00000430278 523 ntTSL 416.55■□□□□ 0.249e-7■■■■□ 25.8
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