Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIX2Q9NPC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX2Q9NPC8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms