Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB18Q9NP72 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB18Q9NP72 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms